В 1775 году на месте сегодняшнего Следственного изолятора N1 ("Матросской тишины") был основан смирительный дом для «предерзостных», который находился в ведении Общества призрения.
Смирительный дом и "дом ума лишенных" на карте 1817 года:
В 1870 году смирительный дом был переименован в Московскую исправительную тюрьму на 300 мужчин и 150 женщин.
В 1918 г. на базе тюрьмы был создан Реформаторий для несовершеннолетних осужденных, затем Кожевническая исправительная колония. В 1946-56 годах здесь находилась тюрьма № 14 Управления МВД по Моск. области; с 1956 г. тюрьма, затем СИЗО № 1 ГУВД Москвы.
Первоначально здание тюрьмы имело 2 режимных корпуса, вмещавших более 2 тыс. заключенных. В 1949 г. число режимных корпусов увеличилось до 3. В 1949-53 гг. в 3-м корпусе размещалась спецтюрьма, где содержались нацистские преступники, а также заключенные, работавшие в Особом техническом бюро МВД.
В 1953-97 гг. в этом корпусе содержались несовершеннолетние, с 1999 г. - туберкулезное отделение. С 1997 г. СИЗО № 1 подчинялся Главному управлению исполнения наказаний (ГУИН) Министерства юстиции РФ. На тот момент в нем содержались до 5 тыс. заключенных, находящихся под следствием или ожидающих вступления приговора в законную силу.
Тюрьма была преобразована из детской воспитательной колонии в 1945 году. Начало функционирования в полном объёме — 1946 год.